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28 octobre 2020 12:23

2 novembre 2020 21:53

Le cocoyam (Xanthosoma sagittifolium (L.)), une culture de tubercules importante dans les tropiques, est gravement touché par la maladie de la pourriture des racines du cocoyame (CRRD) causée par Pythium myriotylum. Le génotype du cocoyam blanc est très sensible tandis que le cocoyam rouge a une certaine tolérance de terrain au CRRD. Les isolats fluorescents de Pseudomonas obtenus à partir de la rhizosphère de cocoyams rouges et blancs sains de trois champs différents au Cameroun ont été caractérisés taxonomiquement. La rhizosphère de cocoyam a été enrichie avec le complexe P. fluorescens et des isolats de P. putida indépendamment du génotype de la plante. Les analyses LC – MS et RMN ont révélé que 50% des isolats de Pseudomonas produisaient des lipopeptides cycliques (CLP) comprenant l'entolysine, la lokisine, le WLIP, la putisolvine et la xantholysine avec huit nouveaux CLP. En général, les types de CLP étaient liés à des groupes taxonomiques spécifiques au sein des pseudomonades fluorescentes. Les bactéries représentatives productrices de CLP ont montré un contrôle efficace contre le CRRD tandis que les CLP purifiés ont provoqué une ramification des hyphes ou une fuite des hyphes chez P. myriotylum. La structure du cocoyamide A, un CLP qui est principalement produit par les isolats du groupe P. koreensis au sein du complexe P. fluorescens est décrite. Par rapport au cocoyam blanc, la rhizosphère du cocoyam rouge semblait supporter un spectre CLP plus diversifié. Reste à savoir si cela contribue à la tolérance de champ affichée par le cocoyam rouge.

Cocoyam (Xanthosoma sagittifolium (L.)), an important tuber crop in the tropics, is severely affected by the cocoyam root rot disease (CRRD) caused by Pythium myriotylum. The white cocoyam genotype is very susceptible while the red cocoyam has some field tolerance to CRRD. Fluorescent Pseudomonas isolates obtained from the rhizosphere of healthy red and white cocoyams from three different fields in Cameroon were taxonomically characterized. The cocoyam rhizosphere was enriched with P. fluorescens complex and P. putida isolates independent of the plant genotype. LC–MS and NMR analyses revealed that 50% of the Pseudomonas isolates produced cyclic lipopeptides (CLPs) including entolysin, lokisin, WLIP, putisolvin and xantholysin together with eight novel CLPs. In general, CLP types were linked to specific taxonomic groups within the fluorescent pseudomonads. Representative CLP-producing bacteria showed effective control against CRRD while purified CLPs caused hyphal branching or hyphal leakage in P. myriotylum. The structure of cocoyamide A, a CLP which is predominantly produced by P. koreensis group isolates within the P. fluorescens complex is described. Compared with the white cocoyam, the red cocoyam rhizosphere appeared to support a more diverse CLP spectrum. It remains to be investigated whether this contributes to the field tolerance displayed by the red cocoyam.

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Environmental Microbiology

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1019-1034

2019

1 janvier 2019

10.1111/1462-2920.14520 Le DOI est une URL unique de référencement d'une publication. Il est donc plus fiable et permanent qu'une URL classique

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