R5XBAUKM

2240

20 novembre 2020 17:08

20 novembre 2020 17:08

Les vignerons utilisent depuis longtemps le cuivre comme traitement fongicide conventionnel sur la vigne et ce n'est que récemment que l'utilisation d'agents de lutte biologique a représenté une alternative prometteuse. La plupart des études qui étudient l'impact des traitements fongicides se concentrent sur des microbes pathogènes spécifiques. Dans le présent travail, au contraire, une expérience de terrain menée en Afrique du Sud montre le changement microbien saisonnier se produisant sur les feuilles de vigne, périodiquement traitées avec deux traitements fongicides différents: le sulfate de cuivre et Lactobacillus plantarum MW-1. Dans ce travail, les données NGS ont été combinées avec des qPCR spécifiques à la souche et à la communauté pour révéler le changement des communautés microbiennes tout au long de la saison de croissance et mettre en évidence l'impact des fongicides sur le microbiote. Seule la famille des Lactobacillacées change systématiquement entre les traitements, tandis que la communauté bactérienne est restée relativement stable dans le temps. MW-1 a été détecté exclusivement sur les feuilles traitées par pulvérisation biologique. À l'inverse, la communauté fongique a été largement façonnée par le temps d'échantillonnage, soulignant la succession de différents taxons dominants au fil des mois. Entre les traitements, seuls quelques taxons fongiques ont semblé changer de manière significative et la charge fongique était également comparable. Le suivi de la dynamique de la communauté microbienne sous différents traitements fongicides peut conseiller le meilleur moment pour appliquer les traitements aux plantes, vers la réalisation de pratiques agricoles plus durables.

Winemakers have long used copper as a conventional fungicide treatment on grapevine and only recently, the use of biocontrol agents depicted a promising alternative. Most of the studies that investigate the impact of fungicide treatments, focus on specific pathogenic microbes. In the present work instead, a field experiment conducted in South Africa shows the seasonal microbial change occurring on grapevine leaves, periodically treated with two different fungicide treatments: copper sulphate and Lactobacillus plantarum MW-1. In this work, NGS data were combined with strain-specific and community qPCRs to reveal the shift of the microbial communities throughout the growing season and highlight the impact of fungicides on the microbiota. Only the family of Lactobacillaceae systematically changed between treatments, while the bacterial community remained relatively stable over time. MW-1 was exclusively detected on biocontrol-sprayed leaves. Conversely, the fungal community was largely shaped by sampling time, underlining the succession of different dominant taxa over the months. Between treatments, only a few fungal taxa appeared to change significantly and the fungal load was also comparable. Monitoring the dynamics of the microbial community under different fungicide treatments may advise the best timing to apply treatments to the plants, toward the realization of more sustainable agricultural practices.

None

• AB - Utile à l'AB
• FREDO lutte
• PRODUIT vin
• biocontrôle
• cuivre
• fungicide
• viticulture

Scientific Reports

10

681

2020-01-20

20 janvier 2020

10.1038/s41598-019-56741-z Le DOI est une URL unique de référencement d'une publication. Il est donc plus fiable et permanent qu'une URL classique

2045-2322 L’ISSN est un code de 8 chiffres servant à identifier les journaux, revues, magazines, périodiques de toute nature et sur tous supports, papier comme électronique.