QA3QVHBN

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28 octobre 2020 12:23

2 novembre 2020 21:54

Les pesticides conventionnels ou chimiques ayant un impact négatif sur l'environnement et la santé des agriculteurs et des consommateurs, il devient pertinent de développer des solutions alternatives pour limiter leur utilisation. Dans ce contexte, des stratégies innovantes pour accélérer le développement d'agents de biocontrôle sont les bienvenues. Depuis une dizaine d'années, il est démontré que les lipopeptides sont des armes très efficaces contre les champignons responsables de maladies des cultures. Les lipopeptides sont des métabolites secondaires, produits par de nombreux micro-organismes, y compris des rhizobactéries bénéfiques. Les voies de biosynthèse des lipopeptides comprennent des peptides synthétases non tribosomales. Ces complexes enzymatiques modulaires fonctionnent comme des chaînes d'assemblage pour construire les peptides étape par étape, conduisant à la production de composés peptidiques originaux avec des caractéristiques spécifiques telles que la présence de monomères non protéinogènes et de structures cycliques et ramifiées. Dans cet article, sont présentés les outils bioinformatiques Florine et Norine, spécialement dédiés aux synthétases non ribosomales et leurs produits. Leur utilisation est principalement axée sur la découverte de lipopeptides produits par Bacillus ou Pseudomonas car ils semblent représenter un réservoir polyvalent de métabolites secondaires actifs aux activités prometteuses pour des applications dans le domaine phytosanitaire.

As conventional or chemical pesticides have negative impact on environment and health of both farmer and consumers, it becomes relevant to develop alternative solutions to limit their use. In this context, innovative strategies to accelerate the development of biocontrol agents are welcome. For a decade of years, it has been demonstrated that lipopeptides are very efficient weapons against fungi responsible for crop diseases. Lipopeptides are secondary metabolites, produced by many microorganisms including beneficial rhizobacteria. The lipopeptide biosynthetic pathways include nonribosomal peptide synthetases. These modular enzymatic complexes work as assembly lines to build the peptides step by step, leading to the production of original peptide compounds with specific features as the presence of non proteinogenic monomers and cyclic and branched structures. In this paper, Florine and Norine bioinformatics tools, especially dedicated to non-ribosomal synthetases and their products are presented. Their use is mainly focused on the discovery of lipopeptides produced by Bacillus or Pseudomonas because they seem to represent a versatile reservoir of active secondary metabolites with promising activities for applications in phytosanitary area.

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• AB - Utile à l'AB
• FREDO lutte
• biocontrôle

European Journal of Plant Pathology

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993-1001

2018-12-01

1 décembre 2018

10.1007/s10658-018-1544-2 Le DOI est une URL unique de référencement d'une publication. Il est donc plus fiable et permanent qu'une URL classique

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