K532IWX7

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4 novembre 2020 13:16

5 janvier 2021 09:54

Les bactériophages (ou phages) spécifiques des souches d'Escherichia coli productrices de toxines Shiga (STEC) sont fréquemment isolés des environnements associés aux animaux, principalement parce que les ruminants sont le réservoir naturel des STEC. Cependant, on en sait peu sur ces phages dans les environnements de production. L'objectif de cette étude était de déterminer les effets des facteurs environnementaux sur la prévalence des phages lytiques contre O157 et les six premiers STEC non O157 dans une ferme biologique. Au total, 370 échantillons ont été prélevés dans une ferme biologique, contenant des zones animales et productrices de produits, pendant 1 an. Un cocktail bactérien, comprenant des souches d'E. Coli non pathogènes et pathogènes, a été utilisé pour l'isolement des phages. Pendant ce temps, des méthodes de culture et PCR ont été utilisées pour isoler les souches STEC. Des informations météorologiques ont également été recueillies pour chaque sortie d'échantillonnage. Vingt-huit échantillons contenaient des phages lytiques contre STEC (ou phages infectant les STEC), dont 26 ont été collectés dans la zone active sur l'animal. De plus, la saison hivernale avait une prévalence de phages plus élevée que les autres saisons, probablement en raison des fortes précipitations de pluie. Les phages appartenant à la famille des Myoviridae et ceux lytiques contre STEC O103 étaient les plus répandus. Un E. coli O103: H2 a été isolé à partir d'un échantillon d'eau où aucun phage infectant STEC O103 n'a été trouvé. De plus, aucun STEC O103 n'était présent dans les échantillons contenant des phages infectant STEC O103. Les résultats indiquent que l'animal est le principal facteur contribuant à la prévalence des phages infectant les STEC dans l'environnement environnant de la ferme biologique, et la présence de ces phages contribue à une corrélation négative avec leurs hôtes STEC.

Bacteriophages (or phages) specific to Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) strains are frequently isolated from animal-associated environments primarily because ruminant animals are the natural reservoir of STEC. However, little is known about these phages in produce-growing environments. The objective of this study was to determine the effects of environmental factors on the prevalence of the phages lytic against O157 and the top six non-O157 STEC on an organic farm. A total of 370 samples were collected from an organic farm, containing animal-active and produce-growing areas, for 1 year. A bacterial cocktail, including nonpathogenic and pathogenic E. coli strains, was used for phage isolation. Meanwhile, culture methods and PCR were used to isolate STEC strains. Weather information was also collected for each sampling trip. Twenty-eight samples contained phages lytic against STEC (or STEC-infecting phages), of which 26 were collected from the animal-active area. Moreover, the winter season had a higher phage prevalence than other seasons, likely due to high rain precipitation. The phages belonging to the Myoviridae family and those lytic against STEC O103 were the most prevalent. One E. coli O103:H2 was isolated from a water sample where no STEC O103-infecting phages were found. Additionally, no STEC O103 was present in the samples containing STEC O103-infecting phages. The findings indicate that animal is the primary factor contributing to the prevalence of the STEC-infecting phages in the surrounding environment of the organic farm, and the presence of these phages contributes to a negative correlation with their STEC hosts.

None

• AB - Spécifique
• FREDO environnement
• biocontrôle

Journal of Food Safety

n/a

e12865

10/2020

1 octobre 2020

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