A Real-Time Quantitative PCR Method Specific for Detection and Quantification of the First Commercialized Genome-Edited Plant

Type de document
journalArticle
Langue source
Anglais
Titre français
Une méthode de PCR quantitative en temps réel spécifique pour la détection et la quantification de la première usine commercialisée éditée par le génome
Titre anglais
A Real-Time Quantitative PCR Method Specific for Detection and Quantification of the First Commercialized Genome-Edited Plant
Auteur(s)
  • CHHALLIYIL Pradheep
  • ILVES Heini
  • KAZAKOV Sergei A.
  • HOWARD Stephanie J.
  • JOHNSTON Brian H.
  • FAGAN John
Editeur(s)
Autre(s)
Id
JH8BFZZB
Version
2405
Date ajout
28 octobre 2020 12:25
Date modification
3 novembre 2020 17:51
Résumé français
La discussion concernant le statut réglementaire des cultures modifiées par le génome s'est concentrée sur la précision de l'édition et sur les doutes concernant la faisabilité d'un suivi analytique conforme aux réglementations existantes sur les OGM. Des méthodes de détection efficaces sont importantes, à la fois pour l'application de la réglementation et la traçabilité en cas d'impacts de biosécurité, environnementaux ou socio-économiques. Ici, nous abordons la question d'analyse pour la première fois en laboratoire et rapportons le développement réussi d'une méthode de détection quantitative par PCR pour la première culture éditée sur le génome commercialisée, un canola avec une seule paire de bases éditant une tolérance aux herbicides. La méthode est très sensible et spécifique (limite de quantification, 0,05%), compatible avec les normes de pratique, d'équipement et d'expertise typiques des laboratoires OGM, et facilement intégrable dans leurs flux de travail analytiques, y compris l'utilisation de l'approche matricielle. La méthode, validée par un laboratoire indépendant, répond à toutes les exigences légales pour les méthodes d'analyse des OGM dans des juridictions telles que l'UE, est conforme aux normes d'accréditation ISO17025 et a été placée dans le domaine public. Ayant développé une méthode qPCR pour la classe la plus difficile de modifications du génome, les variants mononucléotidiques, cette recherche suggère que le développement de méthodes basées sur la qPCR peut être applicable à pratiquement tous les organismes modifiés par le génome. Cette avancée dissipe les doutes quant à la faisabilité d'étendre l'approche réglementaire actuellement employée pour les OGM à base d'ADN recombinant aux organismes modifiés par le génome.
Résumé anglais
Discussion regarding the regulatory status of genome-edited crops has focused on precision of editing and on doubts regarding the feasibility of analytical monitoring compliant with existing GMO regulations. Effective detection methods are important, both for regulatory enforcement and traceability in case of biosafety, environmental or socio-economic impacts. Here, we approach the analysis question for the first time in the laboratory and report the successful development of a quantitative PCR detection method for the first commercialized genome-edited crop, a canola with a single base pair edit conferring herbicide tolerance. The method is highly sensitive and specific (quantification limit, 0.05%), compatible with the standards of practice, equipment and expertise typical in GMO laboratories, and readily integrable into their analytical workflows, including use of the matrix approach. The method, validated by an independent laboratory, meets all legal requirements for GMO analytical methods in jurisdictions such as the EU, is consistent with ISO17025 accreditation standards and has been placed in the public domain. Having developed a qPCR method for the most challenging class of genome edits, single-nucleotide variants, this research suggests that qPCR-based method development may be applicable to virtually any genome-edited organism. This advance resolves doubts regarding the feasibility of extending the regulatory approach currently employed for recombinant DNA-based GMOs to genome-edited organisms.
Note
None
CRAW tags
  • AB - Transversal
  • FREDO authentification et traçabilité
  • FREDO qualité des produits
  • OGM
WEB tags
  • GMO detection
  • GMO quantitation
  • biosafety
  • genome-edited crops
  • real-time quantitative PCR
  • regulatory enforcement
  • traceability
Titre de la publication
Foods
Volume
9
Pages
1245
Date caractères
2020/9
Date publication
24 septembre 2020
Doi
10.3390/foods9091245 Le DOI est une URL unique de référencement d'une publication. Il est donc plus fiable et permanent qu'une URL classique