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28 octobre 2020 12:25

4 novembre 2020 08:53

L'agriculture biologique est de plus en plus encouragée comme moyen de réduire l'impact environnemental des engrais artificiels, des pesticides, des herbicides et des antibiotiques dans les systèmes laitiers conventionnels. Ces facteurs affectent potentiellement les communautés microbiennes des étapes de production (sol, ensilage, fumier et lait) de l'ensemble du cycle agricole. Cependant, on ne sait pas si le microbiote représentatif des différentes étapes de production reflète différentes pratiques agricoles - telles que l'agriculture conventionnelle par rapport à l'agriculture biologique. De plus, la translocation de la communauté microbienne à travers les étapes de production est peu étudiée. Nous avons séquencé les communautés microbiennes d'échantillons de sol, d'ensilage, de fumier et de lait provenant de fermes laitières biologiques et conventionnelles aux Pays-Bas. Nous avons constaté que la structure communautaire des champignons et des bactéries du sol différait considérablement selon les types de sol, mais pas entre les systèmes agricoles biologiques et conventionnels. Les communautés microbiennes de l'ensilage ne différaient pas non plus entre les systèmes conventionnels et biologiques. Néanmoins, le microbiote des excréments des vaches et les communautés fongiques du lait étaient significativement structurés par la pratique agricole. Nous concluons que si les étapes de production des exploitations laitières semblent déconnectées en termes de transfert microbien, certaines pratiques spécifiques à chaque système agricole, comme le contenu de l'alimentation et l'utilisation d'antibiotiques, sont des moteurs potentiels de changements dans le microbiote de la vache. , y compris le lait produit. Cela peut refléter des différences dans la santé des animaux d'élevage et la qualité des produits laitiers selon les pratiques d'élevage.

Organic farming is increasingly promoted as a means to reduce the environmental impact of artificial fertilizers, pesticides, herbicides and antibiotics in conventional dairy systems. These factors potentially affect the microbial communities of the production stages (soil, silage, dung and milk) of the entire farm cycle. However, understanding whether the microbiota representative of different production stages reflect different agricultural practices – such as conventional vs. organic farming – is unknown. Furthermore, the translocation of the microbial community across production stages is scarcely studied. We sequenced the microbial communities of soil, silage, dung and milk samples from organic and conventional dairy farms in the Netherlands. We found that community structure of soil fungi and bacteria significantly differed among soil types, but not between organic vs conventional farming systems. The microbial communities of silage also did not differ among conventional and organic systems. Nevertheless, the dung microbiota of cows, and the fungal communities in the milk were significantly structured by agricultural practice. We conclude that, while the production stages of dairy farms seem to be disconnected in terms of microbial transfer, certain practices specific of each agricultural system, such as the content of diet and the use of antibiotics, are potential drivers of shifts in the cow’s microbiota, including the milk produced. This may reflect differences in farm animal health and quality of dairy products depending on farming practices.

None

• AB - Modalité bio
• FREDO qualité des produits
• FREDO santé animale
• GEO Etats-Unis
• GEO France
• GEO Pays-Bas
• bovin laitier
• comparaison
• lait

• dung
• milk
• silage
• soil
• grassland
• microbiome

Frontiers in Microbiology

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2020

1 janvier 2020

10.3389/fmicb.2020.01746 Le DOI est une URL unique de référencement d'une publication. Il est donc plus fiable et permanent qu'une URL classique

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