Quantifying the effect of human practices on S. cerevisiae vineyard metapopulation diversity
Type de document
journalArticle
Langue source
Anglais
Titre français
Quantifier l'effet des pratiques humaines sur la diversité de la métapopulation du vignoble de S. cerevisiae
Titre anglais
Quantifying the effect of human practices on S. cerevisiae vineyard metapopulation diversity
Auteur(s)
- BÖRLIN Marine
- CLAISSE Olivier
- ALBERTIN Warren
- SALIN Franck
- LEGRAS Jean-Luc
- MASNEUF-POMAREDE Isabelle
Editeur(s)
Autre(s)
Id
G73WSMZG
Version
2954
Date ajout
28 octobre 2020 12:28
Date modification
28 octobre 2020 12:28
Résumé français
Saccharomyces cerevisiae est le principal acteur de la fermentation du vin mais à l'heure actuelle, on en sait encore peu sur les facteurs qui influent sur sa distribution dans les vignobles. Dans cette étude, 23 vignobles et 7 caves ont été échantillonnés sur 2 années consécutives dans les régions de Bordeaux et de Bergerac. L'impact de la géographie et du système agricole et la relation entre les populations de raisins et de cuves ont été évalués à l'aide d'une collection de 1374 isolats de raisins merlot S. cerevisiae et de 289 isolats de cuves analysés à 17 loci microsatellites. Une très grande diversité génétique de souches de S. cerevisiae a été obtenue à partir d'échantillons de raisins, plus élevée dans un système de culture conventionnel que dans un système biologique. L'appellation géographique et le domaine viticole ont un impact significatif sur la structure de la population de S. cerevisiae, alors que le type de système d'exploitation a un faible effet global. En comparant les populations de cave et de vignoble, nous avons mis en évidence le lien étroit entre les deux compartiments, basé sur la forte proportion d'isolats de raisin (25%) liés aux démarreurs commerciaux utilisés en cave et sur l'estimation des flux de genes bidirectionnels entre le vignoble et le compartiments de cave.
Résumé anglais
Saccharomyces cerevisiae is the main actor of wine fermentation but at present, still little is known about the factors impacting its distribution in the vineyards. In this study, 23 vineyards and 7 cellars were sampled over 2 consecutive years in the Bordeaux and Bergerac regions. The impact of geography and farming system and the relation between grape and vat populations were evaluated using a collection of 1374 S. cerevisiae merlot grape isolates and 289 vat isolates analyzed at 17 microsatellites loci. A very high genetic diversity of S. cerevisiae strains was obtained from grape samples, higher in conventional farming system than in organic one. The geographic appellation and the wine estate significantly impact the S. cerevisiae population structure, whereas the type of farming system has a weak global effect. When comparing cellar and vineyard populations, we evidenced the tight connection between the two compartments, based on the high proportion of grape isolates (25%) related to the commercial starters used in the cellar and on the estimation of bidirectional geneflows between the vineyard and the cellar compartments.
Note
None
CRAW tags
- AB - Modalité bio
- FREDO transformation et valorisation
- PRODUIT vin
- fermentation
WEB tags
Titre de la publication
Scientific Reports
Volume
10
Pages
16214
Date caractères
2020-10-01
Date publication
1 octobre 2020
Doi
10.1038/s41598-020-73279-7
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Issn
2045-2322
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