EGKBRQR6

13068

28 octobre 2020 12:24

3 novembre 2020 12:03

La communauté fongique sur les racines, les bases des tiges, les tiges et les grains de blé d'hiver de culture biologique a été analysée en utilisant le polymorphisme terminal de longueur des fragments de restriction (T-RFLP) combiné au clonage et au séquençage de la région ITS. Les changements dans la composition des champignons dans différentes parties de la plante et au fil du temps ainsi que les interactions entre les champignons ont également été étudiés. Parmi les 58 taxons fongiques trouvés, les plus courants étaient Davidiella macrospora, Cladosporium spp., Tetracladium maxilliforme, Didymella exitialis, Microdochium nivale et une espèce non identifiée parmi les Ascomycètes. Plusieurs agents pathogènes potentiels du blé ont été découverts: Fusarium spp. y compris F. poae et G. avenacea (F. avenaceum), Microdochium nivale, Oculimacula yallundae, Parastagonospora nodorum et Zymoseptoria tritici et la plupart d'entre eux étaient présents sur toutes les parties de la plante. La partie de la plante a le plus affecté la colonisation fongique du blé comme l'a montré à la fois l'analyse multivariée de l'ensemble de la communauté fongique et l'analyse basée sur les espèces identifiées. La composition des communautés fongiques dans différentes parties a changé au cours de la saison de croissance, mais aucun schéma commun à l'ensemble de la culture n'a pu être observé. Les changements les plus dynamiques et les plus significatifs ont été observés chez les levures. Des interactions significatives positives et négatives entre des combinaisons par paires de pathogènes ont été observées. Des associations significatives positives ont également été trouvées entre les agents pathogènes et d'autres champignons.

The fungal community on the roots, stem bases, stems and grains of organically grown winter wheat was analysed using terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) combined with cloning and sequencing of the ITS region. The changes in the composition of fungi in different plant parts and over time as well as interactions between fungi were also investigated. Among 58 fungal taxa found the most common were Davidiella macrospora, Cladosporium spp., Tetracladium maxilliforme, Didymella exitialis, Microdochium nivale and an unidentified species within Ascomycetes. Several potential wheat pathogens were found: Fusarium spp. including F. poae and G. avenacea (F. avenaceum), Microdochium nivale, Oculimacula yallundae, Parastagonospora nodorum and Zymoseptoria tritici and most of them were present on all plant parts. Plant part affected the most the fungal colonization of wheat as was shown both by multivariate analysis of the whole fungal community as well as the analysis based on the identified species. The composition of fungal communities in different parts changed during the growing season but no pattern common for the whole crop could be observed. The most dynamic and significant changes were found among yeasts. Both positive and negative significant interactions between pairwise combinations of pathogens were observed. Positive significant associations were also found between pathogens and other fungi.

None

• AB - Spécifique
• FREDO biologie et travail du sol
• FREDO santé végétale
• SPECIES blé
• interaction
• pathogène

European Journal of Plant Pathology

146

401-417

2016-10-01

1 octobre 2016

10.1007/s10658-016-0927-5 Le DOI est une URL unique de référencement d'une publication. Il est donc plus fiable et permanent qu'une URL classique

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