Proteomic changes and endophytic micromycota during storage of organically and conventionally grown carrots
Type de document
journalArticle
Langue source
Anglais
Titre français
Modifications protéomiques et micromycotes endophytes pendant le stockage des carottes de culture biologique et conventionnelle
Titre anglais
Proteomic changes and endophytic micromycota during storage of organically and conventionally grown carrots
Auteur(s)
- LOUARN Sébastien
- NAWROCKI Arkadiusz
- THORUP-KRISTENSEN Kristian
- LUND Ole S.
- JENSEN Ole N.
- COLLINGE David B.
- JENSEN Birgit
Editeur(s)
Autre(s)
Id
CA5U5WQR
Version
2136
Date ajout
28 octobre 2020 12:23
Date modification
30 octobre 2020 18:23
Résumé français
L'état physiologique des racines de carottes pendant une longue conservation au froid est déterminant pour une qualité post-récolte élevée. Nous avons étudié les différences dans le protéome et le micromycote des carottes de culture biologique et conventionnelle pendant six mois de stockage. Les niveaux de seulement 15 protéines ont changé de niveau pendant le stockage. Les protéines impliquées dans l'adaptation au stress au froid et les composants du cytosquelette ont changé; ces changements dans les niveaux de protéines spécifiques se sont produits principalement au cours du premier mois, démontrant une adaptation aux conditions de stockage et que les carottes étaient par la suite stables, indiquant une qualité de carotte stable. Les changements observés étaient similaires dans les deux systèmes de culture. En utilisant à la fois l'isolement biologique et une PCR fongique ciblant la région ITS, nous avons identifié plusieurs espèces endophytes appartenant à l'Ascomycota. Les taxons les plus fréquemment rencontrés étaient le tétracladium, le leptodontidium, les nectriacées et le phoma qui sont connus pour être présents sous forme d'endophytes racinaires ou de champignons associés aux racines. En ce qui concerne les données protéomiques, aucune différence statistiquement significative cohérente dans les micromycotes n'a été observée entre les deux systèmes de culture. Nous concluons que le système de culture n'a pas eu d'influence sur la qualité post-récolte des carottes pendant six mois d'entreposage frigorifique.
Résumé anglais
The physiological state of carrot roots during extended cold-storage is decisive for high postharvest quality. We have investigated differences in the proteome and micromycota of organically and conventionally grown carrots during six months of storage. The levels of only 15 proteins changed in level during storage. Proteins involved in cold stress adaptation and cytoskeleton components changed; these changes in specific protein levels occurred mainly during the first month demonstrating adaptation to storage conditions and that the carrots were subsequently stable, indicating stable carrot quality. The changes observed were similar in the two cropping systems. Using both biological isolation and a fungal PCR targeting the ITS region, we identified several endophytic species belonging to the Ascomycota. The most frequently encountered taxa were Tetracladium, Leptodontidium, Nectriaceae and Phoma which are known to occur as root endophytes or as root-associated fungi. As for the proteomics data, no consistent statistically significant differences in micromycota were observed between the two cropping systems. We conclude that cropping system did not have an influence on the postharvest quality of the carrots during six months of cold storage.
Note
None
CRAW tags
- AB - Modalité bio
- FREDO conservation des productions
- SPECIES carotte
- légumes
- organic production
- stockage
WEB tags
- carrot proteome
- cold storage
- endophytic micromycota
Titre de la publication
Postharvest Biology and Technology
Volume
76
Pages
26-33
Date caractères
February 1, 2013
Date publication
1 février 2013
Doi
10.1016/j.postharvbio.2012.08.011
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Issn
0925-5214
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