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13 janvier 2021 09:42

13 janvier 2021 09:42

Les microorganismes permettent d’augmenter la production agricole, ils jouent également un rôle important dans la diminution de l’utilisation des pesticides tout en maintenant les rendements (influence de microbes sur la sensibilité à la rouille). Ces dernières années, la génétique végétale a permis de faire de grandes avancées sur le fonctionnement de ces microorganismes (méthodes moléculaires à haut débit pour mieux comprendre le microbiome) + arrivée du nouveau concept d’holobionte (les microorganismes ne sont plus considérés comme isolés mais interagissant, holostiques). Le génotype de la plante peut-il influencer le microbiome ? Peut-il être utile pour la sélection des microorganismes ? Oui, 5-10 % de variation dans la composition du microbiome peuvent être expliqués par le génotype végétal + influence de paramètres environnementaux. Atelier EUKARIPIA : détermination des chances de sélection du microbiome. Outils utilisés : sélection phénotype à haut débit, complexité microbienne, machine learning, sélection du génotype. Au Fibl, sélection de résistances sur le pois (maladies sélectives du lien sol-plante). Les champignons mycorrhysiens peuvent fournir une bonne estimation de la résistance aux maladies. C’est un élément supplémentaire à utiliser dans un premier ^phase pour la sélection de pois résistants. Sélection du génome associé à la diversité fonctionnelle du microbiome avec recrutement des microbes clé. Ccl : utilisation de biomarqueurs qui dirigent la coopération plante microbiome. Cette info est à fournir aux sélectionneurs.

Microorganisms help increase agricultural production, they also play an important role in reducing the use of pesticides while maintaining yields (influence of microbes on rust sensitivity). In recent years, plant genetics have made it possible to make great advances in the functioning of these microorganisms (high-throughput molecular methods to better understand the microbiome) + arrival of the new concept of holobiont (microorganisms are no longer considered isolated but interacting, holostic). Can the genotype of the plant influence the microbiome? Can it be useful for the selection of microorganisms? Yes, 5-10% variation in the composition of the microbiome can be explained by the plant genotype + influence of environmental parameters. EUKARIPIA workshop: determination of microbiome selection chances. Tools used: high throughput phenotype selection, microbial complexity, machine learning, genotype selection. At Fibl, selection of resistances on peas (selective diseases of the soil-plant link). Mycorrhoidal fungi can provide a good estimate of disease resistance. This is an additional element to be used in a first phase for the selection of resistant peas. Selection of the genome associated with the functional diversity of the microbiome with recruitment of key microbes. Ccl: use of biomarkers that direct plant microbiome cooperation. This info is to be provided to breeders.

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04/12/2020

4 décembre 2020