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28 octobre 2020 12:26

28 octobre 2020 12:26

Les bactéries appartenant au genre Burkholderia vivent dans diverses niches écologiques et présentent un rôle important dans les environnements grâce à l'excrétion d'une grande variété de métabolites secondaires, y compris les peptides modulaires non tribosomaux (PNR) et les polycétides (PK). Ces métabolites représentent une classe importante de produits naturels largement distribués sur le plan biomédical et biologique, notamment les antibiotiques, les sidérophores et les anticancéreux, ainsi que les biopesticides considérés comme une nouvelle source pouvant être utilisée pour défendre la niche écologique des concurrents et pour promouvoir la croissance des plantes. Le but de cette revue est de présenter tous les PNR produits ou potentiellement produits par des souches de Burkholderia, les PNR représentant une source majeure de composés actifs impliqués dans la lutte biologique. La revue est une compilation des résultats d'un grand criblage que nous avons effectué sur 48 génomes séquencés complets disponibles dans NCBI pour identifier les grappes de gènes NRPS, et des données trouvées dans la littérature principalement parce que certains composés intéressants sont produits par des souches non encore séquencées. En plus des NRP, des hybrides NRP / PK sont également inclus. Les caractéristiques spécifiques des groupes de gènes biosynthétiques et des structures des enzymes modulaires responsables de la synthèse, des activités biologiques et des utilisations potentielles en agriculture et en pharmacie des NRP et des hybrides NRP / PK seront également discutées.

Bacteria belonging to the genus Burkholderia live in various ecological niches and present a significant role in the environments through the excretion of a wide variety of secondary metabolites including modular nonribosomal peptides (NRPs) and polyketides (PKs). These metabolites represent a widely distributed biomedically and biocontrol important class of natural products including antibiotics, siderophores, and anticancers as well as biopesticides that are considered as a novel source that can be used to defend ecological niche from competitors and to promote plant growth. The aim of this review is to present all NRPs produced or potentially produced by strains of Burkholderia, as NRPs represent a major source of active compounds implicated in biocontrol. The review is a compilation of results from a large screening we have performed on 48 complete sequenced genomes available in NCBI to identify NRPS gene clusters, and data found in the literature mainly because some interesting compounds are produced by strains not yet sequenced. In addition to NRPs, hybrids NRPs/PKs are also included. Specific features about biosynthetic gene clusters and structures of the modular enzymes responsible for the synthesis, the biological activities, and the potential uses in agriculture and pharmaceutical of NRPs and hybrids NRPs/PKs will also be discussed.

None

• AB - Utile à l'AB
• FREDO lutte

Environmental Science and Pollution Research

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29794-29807

2018-10-01

1 octobre 2018

10.1007/s11356-017-9166-3 Le DOI est une URL unique de référencement d'une publication. Il est donc plus fiable et permanent qu'une URL classique

1614-7499 L’ISSN est un code de 8 chiffres servant à identifier les journaux, revues, magazines, périodiques de toute nature et sur tous supports, papier comme électronique.