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28 octobre 2020 12:38

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La communauté fongique du sol joue un rôle important dans la croissance et la santé des plantes. Dans cette étude, nous avons étudié la diversité fongique et la composition de la communauté dans les racines et le sol de 21 cultivars de pomme de terre (Solanum tuberosum L.) en utilisant un séquençage à haut débit à trois moments différents au cours de la saison de croissance. Dans le sol et les racines, la richesse fongique et l'abondance relative des agents pathogènes et des saprotrophes ont été principalement affectées par la période d'échantillonnage. Bien que la période d'échantillonnage ait affecté la composition fongique du sol, les communautés fongiques des racines ont également été considérablement affectées par le cultivar. Le cultivar a eu le plus fort effet sur la diversité des agents pathogènes et l'abondance d'espèces pathogènes particulières. Nos résultats démontrent des changements dans les communautés fongiques du sol et des racines de la pomme de terre au cours de la saison de croissance, tout en soulignant l'importance du cultivar de pomme de terre sur les communautés fongiques des racines et l'abondance des agents pathogènes.

The soil fungal community plays an important role in determining plant growth and health. In this study, we investigated the fungal diversity and community composition in the roots and soil of 21 potato (Solanum tuberosum L.) cultivars using high-throughput sequencing at three different time points across the growing season. In soil and roots, the fungal richness and relative abundance of pathogens and saprotrophs were mainly affected by sampling time. While sampling time affected fungal composition in soil, root fungal communities were also significantly affected by cultivar. The cultivar had the strongest effect on diversity of pathogens and abundance of particular pathogen species. Our results demonstrate changes in soil and root fungal communities of potato over the growing season, as well as highlighting the importance of potato cultivar on root fungal communities and abundance of pathogens.

None

• AB - Utile à l'AB
• FREDO biologie et travail du sol
• FREDO étude des variétés
• SPECIES Solanum tuberosum L.
• agroecosystem
• pomme de terre

• fungal diversity
• fungal guild
• high-throughput sequencing
• host specificity
• potato cultivars

Agronomy

10

1535

2020/10

24 octobre 2020

10.3390/agronomy10101535 Le DOI est une URL unique de référencement d'une publication. Il est donc plus fiable et permanent qu'une URL classique