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19 novembre 2020 12:03

19 novembre 2020 12:03

Une production agricole respectueuse de l'environnement nécessite la manipulation des interactions microbes-plantes, ce qui nécessite une meilleure compréhension de la manière dont les pratiques agricoles influencent le microbiote du sol. Nous avons étudié l'effet du traitement conventionnel et organique sur la richesse bactérienne du sol, sa composition et le potentiel fonctionnel prévu. Le séquençage de l'ARNr 16S a été appliqué aux sols des parcelles adjacentes recevant un engrais synthétique ou organique, où deux cultures ont été cultivées dans le cadre du traitement, l'homogénéisation pour des différences dans les propriétés du sol, la culture et le climat. L'engrais conventionnel était associé à une diminution du pH du sol, à une accumulation d'Ag, Mn, As, Fe, Co, Cd et Ni; et un enrichissement d'oxydants d'ammoniaque et de dégradants de composés xénobiotiques (par exemple, Candidatus Nitrososphaera, Nitrospira, Bacillus, Pseudomonas). Les sols recevant une fertilisation organique ont été enrichis en Ti (biostimulant des cultures), en bactéries cycliques N et C (dénitrificateurs, par exemple, Azoarcus, Anaerolinea; méthylotrophes, par exemple, Methylocaldum, Methanosarcina) et la suppression des maladies (par exemple, Myxococcales). Certaines fonctions prévues, telles que le métabolisme du glutathion, étaient légèrement, mais significativement enrichies après une application unique de fumier, suggérant une amélioration de la régulation du soufre, de la fixation de l'azote et de la défense des facteurs de stress environnementaux. L'étude souligne que même une seule application de fertilisation organique suffit à provoquer un changement rapide des procaryotes du sol, répondant à la disponibilité di érentielle du substrat en favorisant la santé du sol, similaire aux applications récurrentes.

Environmentally friendly agricultural production necessitates manipulation of microbe–plant interactions, requiring a better understanding of how farming practices influence soil microbiota. We studied the effect of conventional and organic treatment on soil bacterial richness, composition, and predicted functional potential. 16S rRNA sequencing was applied to soils from adjacent plots receiving either a synthetic or organic fertilizer, where two crops were grown within treatment, homogenizing for differences in soil properties, crop, and climate. Conventional fertilizer was associated with a decrease in soil pH, an accumulation of Ag, Mn, As, Fe, Co, Cd, and Ni; and an enrichment of ammonia oxidizers and xenobiotic compound degraders (e.g., Candidatus Nitrososphaera, Nitrospira, Bacillus, Pseudomonas). Soils receiving organic fertilization were enriched in Ti (crop biostimulant), N, and C cycling bacteria (denitrifiers, e.g., Azoarcus, Anaerolinea; methylotrophs, e.g., Methylocaldum, Methanosarcina), and disease-suppression (e.g., Myxococcales). Some predicted functions, such as glutathione metabolism, were slightly, but significantly enriched after a one-time manure application, suggesting the enhancement of sulfur regulation, nitrogen-fixing, and defense of environmental stressors. The study highlights that even a single application of organic fertilization is enough to originate a rapid shift in soil prokaryotes, responding to the differential substrate availability by promoting soil health, similar to recurrent applications.

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• AB - Modalité bio
• FREDO biologie et travail du sol
• FREDO fertilisation
• GEO Espagne
• horticulture

Plants

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1501

2020-11-06

6 novembre 2020

10.3390/plants9111501 Le DOI est une URL unique de référencement d'une publication. Il est donc plus fiable et permanent qu'une URL classique

2223-7747 L’ISSN est un code de 8 chiffres servant à identifier les journaux, revues, magazines, périodiques de toute nature et sur tous supports, papier comme électronique.