4LP96G8Q

2697

8 janvier 2021 16:00

15 mars 2021 11:47

Un projet visant à identifier des mycoherbicides pour lutter contre les adventices a été initié entre l’UMR Agroécologie de Dijon et la société DE SANGOSSE® (Agen). Trois volets ont structuré ce projet à l’issue d’une collecte de prélèvement de 475 plantes représentatives de 23 espèces d’adventices symptomatiques et asymptomatiques en Bourgogne et en Beauce. Le 1er volet reposait sur une approche de type metabarcoding (technologie Illumina), pour évaluer et comparer la diversité des communautés fongiques endophytes des plantes symptomatiques et asymptomatiques. 542 genres fongiques ont ainsi été identifiés. Des taxons associés aux plantes symptomatiques ont été identifiés. Parmi ceux-ci, certains sont des pathogènes connus, d’autres non et ils constituent des pistes à exploiter pour la recherche de candidats mycoherbicides. Le deuxième volet repose sur une approche conventionnelle de microbiologie et pathologie. Une collection de 194 champignons associés aux symptômes des adventices a été constituée. La pathogénicité de ces isolats a été testée grâce à une série de screenings de plus en plus sélectifs qui ont abouti à la sélection de cinq souches, identifiées par séquençage de l’ITS ou d’autres marqueurs taxonomiques. Une souche appartient à l’espèce Boeremia exigua var exigua, une autre à l’espèce Alternaria alternata, deux appartiennent à l’espèce A. penicillata et la dernière au genre Alternaria. Le troisième volet visait à identifier le mode d’action d’une souche par une double approche, métabolomique et microscopique. La souche de B. exigua var exigua secrète des métabolites phytotoxiques mais également infeste et semble détruire les tissus végétaux sous-épidermique de la plante hôte.Ce projet exploratoire a fourni des pistes de taxons fongiques associés à des symptômes observés sur adventices en analysant la diversité par une approche moléculaire et a fourni des souches fongiques, mycoherbicides potentiels, par une approche microbiologique dont on voit bien qu’elle reste une méthode incontournable, malgré ses limites, pour obtenir des candidats fongiques à action herbicide.

A project to identify mycoherbicides to fight against weeds was initiated between UMR Agroécologie de Dijon and the company DE SANGOSSE® (Agen). Three components structured this project after collecting samples from 475 plants representative of 23 symptomatic and asymptomatic weed species in Burgundy and Beauce. The first part was based on a metabarcoding type approach (Illumina technology), to assess and compare the diversity of endophytic fungal communities in symptomatic and asymptomatic plants. 542 fungal genera have thus been identified. Taxa associated with symptomatic plants have been identified. Among these, some are known pathogens, others are not, and they constitute avenues to be exploited in the search for mycoherbicide candidates. The second part is based on a conventional approach of microbiology and pathology. A collection of 194 fungi associated with weed symptoms was assembled. The pathogenicity of these isolates was tested through a series of increasingly selective screenings which resulted in the selection of five strains, identified by sequencing of ITS or other taxonomic markers. One strain belongs to the species Boeremia exigua var exigua, another to the species Alternaria alternata, two belong to the species A. penicillata and the last to the genus Alternaria. The third part aimed to identify the mode of action of a strain using a dual approach, metabolomic and microscopic. The strain of B. exigua var exigua secretes phytotoxic metabolites but also infests and seems to destroy the subepidermal plant tissues of the host plant. This exploratory project has provided clues of fungal taxa associated with symptoms observed on weeds by analyzing the diversity by a molecular approach and provided fungal strains, potential mycoherbicides, by a microbiological approach which we can see clearly that it remains an essential method, despite its limitations, to obtain fungal candidates with herbicidal action.

None

• AB - Utile à l'AB
• FREDO adventice
• FREDO lutte
• GEO France
• biocontrol
• bioherbicide

• biocontrol
• biocontrôle
• champignons endophytes
• endophytic fungi
• interactions adventices-champignons
• mycoherbicides
• métabolites
• métabolites secondaires d’origine fongique
• plantes adventices
• secondary metabolites of fungal origin
• weed-fungi interactions
• weeds

2019-07-08

8 juillet 2019