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28 octobre 2020 12:22

30 octobre 2020 17:08

Malgré la connaissance que les pratiques de gestion, la saisonnalité et la phénologie des plantes ont un impact sur le microbiote du sol; Les effets du système agricole sur le microbiote du sol ne sont pas souvent évalués tout au long de la saison de croissance. Nous avons évalué la diversité bactérienne dans le sol autour des racines de blé au printemps et à l'été 2016 dans le blé d'hiver (Triticum aestivium L.) au Montana, aux États-Unis, à partir de trois systèmes agricoles contrastés: un système sans travail du sol géré chimiquement et deux USDA- systèmes biologiques certifiés dans leur quatrième année, l'un comprenant le travail du sol et l'autre où le pâturage des moutons compense partiellement la fréquence du travail du sol. La richesse bactérienne (intervalle 605–1174 OTU) et la régularité (intervalle 0,80–0,92) ont atteint un sommet au début de juin et ont chuté à la fin juillet (intervalle 92–1190, 0,62–0,92, respectivement), mais n'étaient pas différents selon les systèmes d'exploitation. Les parcelles labourées organiques contenaient plus de genres bactériens putatifs fixateurs d'azote que les deux autres systèmes. Les similitudes des communautés bactériennes ont été considérablement modifiées par la date d'échantillonnage, les températures minimale et maximale au moment de l'échantillonnage, l'abondance bactérienne à la date d'échantillonnage, la richesse totale des mauvaises herbes et la couverture de Taraxacum officinale, Lamium ampleuxicaule et Thlaspi arvense. Cette étude souligne que la diversité des mauvaises herbes, la saison et le système de gestion agricole influencent tous les communautés microbiennes du sol. Les conditions environnementales locales conditionneront fortement toute application pratique visant à améliorer la diversité des sols, en particulier dans les régions semi-arides où le stress abiotique et la variabilité saisonnière de la température et de la disponibilité de l'eau stimulent la production primaire. Ainsi, il est essentiel d'incorporer ou de traiter la saisonnalité dans l'échantillonnage des sols pour la diversité microbienne.

Despite knowledge that management practices, seasonality, and plant phenology impact soil microbiota; farming system effects on soil microbiota are not often evaluated across the growing season. We assessed the bacterial diversity in soil around wheat roots through the spring and summer of 2016 in winter wheat (Triticum aestivium L.) in Montana, USA, from three contrasting farming systems: a chemically-managed no-tillage system, and two USDA-certified organic systems in their fourth year, one including tillage and one where sheep grazing partially offsets tillage frequency. Bacterial richness (range 605–1174 OTUs) and evenness (range 0.80–0.92) peaked in early June and dropped by late July (range 92–1190, 0.62–0.92, respectively), but was not different by farming systems. Organic tilled plots contained more putative nitrogen-fixing bacterial genera than the other two systems. Bacterial community similarities were significantly altered by sampling date, minimum and maximum temperature at sampling, bacterial abundance at date of sampling, total weed richness, and coverage of Taraxacum officinale, Lamium ampleuxicaule, and Thlaspi arvense. This study highlights that weed diversity, season, and farming management system all influence soil microbial communities. Local environmental conditions will strongly condition any practical applications aimed at improving soil diversity, especially in semi-arid regions where abiotic stress and seasonal variability in temperature and water availability drive primary production. Thus, it is critical to incorporate or address seasonality in soil sampling for microbial diversity.

None

• 16S rRNA gene
• AB - Modalité bio
• FREDO adventice
• FREDO biologie et travail du sol
• GEO Etats-Unis
• conventional
• grazing
• labour
• organic
• tillage
• weed diversity

Geoderma

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113989

January 15, 2020

15 janvier 2020

10.1016/j.geoderma.2019.113989 Le DOI est une URL unique de référencement d'une publication. Il est donc plus fiable et permanent qu'une URL classique

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