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8 janvier 2021 17:06

15 mars 2021 11:47

L’utilisation de microorganismes ou de substances naturelles d’origine microbienne est une des solutions alternatives actuellement envisagées pour remplacer partiellement ou totalement les pesticides conventionnels. Dans ce contexte, l’objectif de ce travail de thèse a été d’évaluer le potentiel de biocontrôle des souches de P. syringae. Une étude des lipopeptides produits par les souches du complexe P. syringae a d’abord été réalisée car ces molécules sont connues pour leurs activités antimicrobiennes puis l’activité antifongique des bactéries a été analysée. Pour y parvenir, une collection de 709 souches, représentative de la diversité phylogénétique du complexe P. syringae, a été explorée. Grâce à une stratégie faisant intervenir des approches complémentaires de spectrométrie de masse et de bioinformatique, il a été possible de révéler une forte diversité structurale de lipopeptides : 61 lipopeptides dont 38 nouveaux, répartis dans les 5 familles décrites chez P. syringae (syringafactine, syringomycine, corpeptine, syringopeptines 22 et 25) ont été identifiés. Ces lipopeptides sont produits par 81,1% des souches de la collection étudiée, réparties dans 8 des 13 phylogroupes référencés au sein du complexe P. syringae. Concernant leurs activités, 22,3% des souches ont montré une activité antifongique in vitro. Les lipopeptides, produits par 97,3% des souches antifongiques et retrouvés dans des surnageants de culture bruts et semi-purifiés, sont certainement responsables de ces activités. Enfin, deux souches ont montré, in planta, un potentiel intéressant de biocontrôle de la septoriose du blé, causée par le champignon phytopathogène Zymoseptoria tritici. Leurs surnageants de culture bruts et ultrafiltrés, ont montré des niveaux de protection du blé allant jusqu’à 62% par rapport au témoin d’infection.

The use of microorganisms or natural substances of microbial origin is one of the alternative solutions currently being considered to partially or totally replace conventional pesticides. In this context, the objective of this thesis work was to assess the potential for biocontrol of strains of P. syringae. A study of the lipopeptides produced by the strains of the P. syringae complex was first carried out because these molecules are known for their antimicrobial activities and then the antifungal activity of bacteria was analyzed. To achieve this, a collection of 709 strains, representative of the phylogenetic diversity of the P. syringae complex, was explored. Thanks to a strategy involving complementary approaches of mass spectrometry and bioinformatics, it was possible to reveal a strong structural diversity of lipopeptides: 61 lipopeptides including 38 new ones, distributed in the 5 families described in P. syringae (syringafactin, syringomycin , corpeptin, syringopeptins 22 and 25) have been identified. These lipopeptides are produced by 81.1% of the strains in the collection studied, distributed in 8 of the 13 phylogroups referenced within the P. syringae complex. Regarding their activities, 22.3% of the strains showed antifungal activity in vitro. Lipopeptides, produced by 97.3% of antifungal strains and found in crude and semi-purified culture supernatants, are certainly responsible for these activities. Finally, two strains showed, in planta, an interesting potential for biocontrol of septoria in wheat, caused by the phytopathogenic fungus Zymoseptoria tritici. Their crude and ultrafiltered culture supernatants showed wheat protection levels of up to 62% compared to the infection control.

None

• pseudomonas syringae
• AB - Utile à l'AB
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• FREDO santé végétale
• GEO France

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2020-06-30

30 juin 2020